I cardinali fatti da innocenzo viiiNella notte tra il 10 agosto e l'11 agosto, il Sacro Collegio volle elevare al Soglio pontificio il cardinal Rodrigo Borja y Borja, valenzano. Fu incoronato in San Pietro il 26 agosto successivo con il nome di Alessandro VI. Aveva 61 anni.
Il Conclave era così composto:

• Giuliano della Rovere;O.F.M. vescovo di Ostia e Velletri, arcivescovo di Bologna, amministratore dell'arcidiocesi di Avignone, Decano del Sacro Collegio dei Cardinali (eletto papa con il nome di Giulio II nel Conclave del 1503)
• Rodrigo Lanzol-Borja y Borja (divenuto poi papa Alessandro VI), vescovo di Porto e Santa Rufina, arcivescovo di Valencia, sub-decano del Sacro Collegio dei Cardinali
• Oliviero Carafa, vescovo di Albano
• Giovanni Battista Zeno, vescovo di Frascati
• Giovanni Michiel, vescovo di Palestrina
• Jorge da Costa, vescovo di Albano, arcivescovo di Lisbona
• Francesco Nanni Todeschini-Piccolomini, cardinale diacono di Sant'Eustachio, arcivescovo di Siena (Eletto papa con il nome di Pio III nel Conclave del 1503)
• Girolamo Basso della Rovere, O.F.M., del titolo di San Crisogono, vescovo di Recanati e Macerata
• Raffaele Sansoni Riario, O.F.M., del titolo di San Lorenzo in Damaso
• Domenico della Rovere, titolare di San Clemente, arcivescovo di Torino
• Paolo Fregoso (o Campofregoso), del titolo di San Sisto, arcivescovo di Genova
• Giovanni Battista Savelli, cardinale diacono di San Nicola in Carcere
• Giovanni Colonna, cardinale diacono di Santa Maria in Aquiro
• Giovanni de' Conti, del titolo di San Vitale
• Giovanni Giacomo Sclafenati, del titolo di Santa Cecilia, vescovo di Parma
• Giovanni Battista Orsini, cardinale diacono di Santa Maria Nuova
• Ascanio Maria Sforza Visconti, cardinale diacono di Santi Vito e Modesto
• Lorenzo Cibo de Mari, del titolo di San Marco, arcivescovo di Benevento
• Ardicino della Porta, del titolo di Santi Giovanni e Paolo, vescovo di Aleria
• Antoniotto Pallavicini, del titolo di Santa Prassede, vescovo di Orense
• Maffeo Gherardo, O.S.B. Cam., del titolo di Santi Nereo e Achilleo, Patriarca di Venezia
• Giovanni de' Medici, cardinale diacono di Santa Maria in Domnica (eletto papa con il nome di Leone X nel Conclave del 1513)
• Federico di Sanseverino, cardinale diacono di San Teodoro
• Altri quattro Cardinali facenti parte del sacro Collegio risultarono assenti:
• Luis Juan del Milà y Borja, vescovo di Lérida
• Pedro González de Mendoza, del titolo di Santa Croce in Gerusalemme, arcivescovo di Toledo
• André d'Espinay, del titolo di Santi Silvestro e Martino ai Monti, arcivescovo di Bordeaux e Lione
• Pierre d'Aubusson, cardinale diacono di Sant'Adriano al Foro e Gran Maestro dell'Ordine degli Ospitalieri.